Cụ thể, Chính phủ đã cho phép sử dụng 600 tỉ đồng từ vốn của nhà đầu tư để thực hiện công tác di dời, sau đó trích trả lại 240 tỉ đồng mà Bộ Tài chính đã tạm ứng di dời trước đó. Đồng thời, Chính phủ cũng chấp thuận kiến nghị của Bộ Quốc phòng cho phép gia hạn thời gian di dời nhà máy ra cảng Cái Mép (Bà Rịa - Vũng Tàu) đến năm 2015.
Hiện nay, để giảm thiểu ô nhiễm, phân xưởng tại quận 1 của nhà máy đã chuyển một phần hoạt động sản xuất xuống huyện Nhà Bè và Cần Giờ. Dự kiến, đến tháng 6-2011, TPHCM sẽ phê duyệt quy hoạch khu đất của Nhà máy Ba Son để bộ chủ quản thông qua các phương án xử lý vốn đầu tư trên đất nhà máy cũ.